多重免疫荧光图像分析：QuPath vs CellProfiler

我拿到了一张多色免疫荧光图像，看起来五彩缤纷，不同颜色理论上对应的是不同marker，理想状态下软件能够识别每一个通道。

然而，当我将这张图象导入到分析软件后，我发现它只识别了RGB三原色！！！为什么？我该如何进行后续的分析？

以QuPath为例：在 QuPath 中，图像导入后的自动通道识别通常依赖于图像的元数据或文件格式中的信息，尤其是对于像 OME.TIFF 或其他支持多通道的图像格式。通常是OME-TIFF或confocal多通道图像。

而CaseViewer导出的图像通常是RGB格式（即红、绿、蓝三个通道），适用于常见的图像分析和可视化。如果您使用的是免疫荧光图像，CaseViewer可能会将不同的荧光标记分别映射到不同的颜色通道（例如，CD11B为红色，LY6G为绿色，CXCR2为蓝色）。